1879年,通过市民的倡议,芝加哥艺术学院(the Chicago Academy of Fine Arts)取代了成立于1866年的芝加哥设计学院(the Chicago Academy of Design)。这所根深蒂固的学院承袭了旧有的学院的教育目的,而将“艺术品的组成与展示”以及“以任何适当的方式将关于艺术的教化及延伸”作为该机构的目标,威廉·M·R·弗伦奇担任首任馆长(1885-1914)。
三年后该机构易名为现在为人所熟知的芝加哥艺术博物馆。芝加哥艺术博物馆得最早的艺术收藏支持了该馆的建馆使命,为教育学生而提供了一些范例。成立于1877年的装饰艺术协会(the Chicago Society of Decorative Art),即在1894年隶属于芝加哥艺术博物馆的芝加哥古物收藏家协会(The Antiquarian Society)向刚刚创立的博物馆提供了一批关于挂毯和礼服的慷慨捐赠。(1890年)。1891年,该协会在芝加哥艺术博物馆成立了一个购藏“工业艺术品”的基金。在1893年,芝加哥艺术博物馆购藏了一批关于古典雕塑的模制品的艺术收藏,是迄今为止在美国最大的复制品收藏。
由于在基金方面的短缺,芝加哥艺术博物馆也像大都会艺术博物馆一样得到了博物馆的理事们的赞助。1890年,当时著名的欧洲艺术赞助人阿纳托莱·德米多夫王子(Prince Anatole Demidoff)从他的荷兰大师收藏中向博物馆出售13幅作品——包括哈尔斯、伦勃朗、霍贝玛等人的杰作,其他重要的芝加哥人确保了这次购藏活动。而来自于爱德华·S·斯蒂克尼(Edward S. Stickney)的包括460幅大师复制品版画及收藏基金的捐赠,进一步扩展了芝加哥艺术博物馆的欧洲艺术品收藏。
芝加哥艺术博物馆的董事委员会是由当地的商人领袖所组成,其中有P·D·(P.D. Armour)、(Marshall Field)、查尔斯·哈钦森(Charles Hutchinson, 1854-1924)以及铁路大亨乔治·普尔曼(George Pullman),查尔斯·哈钦森以及著名的艺术收藏家马丁·A·赖尔森(Martin A. Ryerson, 1856-1932)在董事会当中扮演着重要角色。